Основната цел на проекта SISTER е да утвърди ФМИ като водещ център в Югоизточна Европа в областта на ИКТ, и по-конкретно в сферата на софтуерните услуги и интелигентните системи.

От нея произтичат и конкретни задачи:

• Укрепване на човешките ресурси на ФМИ и интегриране с партньори от ЕС;
• Разработване със съдействието на експерти от ЕС на предложение за стратегия за развитието на изследователската дейност във ФМИ в областта на ИКТ;
• Подобряване на капацитета на ФМИ за връзка с бизнеса, за трансфер на технологии и иновации;
• Подобряване на научната инфраструктура на ФМИ;
• Изграждане на дългосрочно сътрудничество на ФМИ с водещи научно-изследователски организации и предприятия в ЕС и държавите от Югоизточна Европа;
• Превръщане на ФМИ е известен изследователски и иновационен център в Югоизточна Европа.